满洲里海关地处内蒙古自治区东北部，与俄、蒙古接壤，得天独厚的地理位置赋予了它独特的历史发展和与众不同的深厚底蕴。满洲里海关历史悠久，是中国陆路口岸最早成立的海关之一。自1908年满洲里分关（满洲里海关的前身）成立至今，已经走过了近百年的历史。2004年2月，经国务院批准，满洲里海关为正厅（局）级海关。
满洲里海关历史悠久，是我国最早设立的海关之一。在建国初期满洲里口岸作为中苏贸易的主动脉，地位和作用十分重要。进出口货运量一直居于全国前列，对国民经济的恢复及国家第一个五年计划的完成做出了重要贡献。继1985年满洲里市被国家定为甲级开放城市之后，1992年又被国务院批准为首批沿边开放城市。满洲里海关业务量急剧扩大，监管方式也由国际铁路联运向铁路、公路、水运、航空等全方位扩展，单一的国家贸易发展成为国贸、地贸、边贸、劳务合作、承包工程等多种贸易方式并存的繁荣局面，所辖口岸也由原来仅有的铁路和公路口岸发展为黑山头、室韦、阿日哈沙特等10个口岸。
近几年，满洲里海关监管进出口货物量一直在300万吨以上，2000年更是突破历史新高，达594.95万吨。其中满洲里铁路口岸进出口贸易值占中俄贸易值的30%左右，成为中俄贸易最大的通商口岸。
多年来，满洲里海关始终坚持从严治关，力争造就一支高素质的海关队伍，以高素质的人才高质量地完成各项工作。同时，不断挖掘内部潜力，加大科技投入，结合口岸实际，自行编制相关程序，建设安装了世界首台H986货运列车在线检查系统。为加快通关速度，改善通关环境奠定了坚实的基础。
在新的世纪，满洲里海关将更好地肩负起自己的职责和使命，在海关总署的领导下，正确处理“依法行政，为国把关”与“服务经济，促进发展”的关系，团结开拓，继往开来，使各项工作再上新的台阶。
现任领导
庞中联，满洲里海关党组书记、关长（正厅局级）男，1953年1月出生，汉族，广西桂林人，中共党员，大学专科毕业，现任满洲里海关党组书记、关长，一级关务监督，负责满洲里海关全面工作，重点联系办公室、人事教育处。1969年2月参加工作，2004年4月任职。
薛颖超，满洲里海关党组成员、副关长（副厅局级）
男，1955年5月出生，汉族，黑龙江齐齐哈尔人，中共党员，大学本科毕业，现任满洲里海关党组成员、副关长，二级关务监督，分管办公室、财务处、机关服务中心、基建办。1975年11月参加工作，2006年11月任职。
王胜，满洲里海关党组成员、副关长（副厅局级）
男，1963年3月出生，汉族，内蒙古呼伦贝尔人，中共党员，大学本科毕业，现任满洲里海关党组成员、副关长，三级关务监督，分管关税征管处、监管通关处、技术处、驻十八里办事处，联系海拉尔海关、海拉尔海关缉私分局。1985年5月参加工作，2005年3月任职。
朱永兴，满洲里海关党组成员、副关长兼缉私局局长（副厅局级）
男，1948年1月出生，汉族，内蒙古呼伦贝尔人，中共党员，大学专科毕业，现任满洲里海关党组成员、副关长兼缉私局局长，二级警监，分管缉私局、稽查处、风险管理处，联系驻通辽办事处、驻通辽办事处缉私分局。1968年7月参加工作，2005年6月任职。
李振江，满洲里海关党组书记、纪检组长（副厅局级）
男，1961年12月出生，汉族，云南临沧人，中共党员，大学专科毕业，现任满洲里海关党组成员、纪检组长，三级关务监督，分管人事教育处、思想政治工作办公室（机关党委办公室）、监察审计室，联系驻赤峰办事处、驻赤峰办事处缉私分局。1979年10月参加工作，2005年12月任职。
刘勇军，满洲里海关党组成员、副关长（副厅局级）
男，1960年4月出生，汉族，内蒙古呼伦贝尔人，中共党员，大学本科毕业，现任满洲里海关党组成员、副关长，三级关务监督，分管审单处、综合统计处、驻车站办事处，联系额尔古纳海关、额尔古纳海关缉私科。1984年7月参加工作，2007年1月任职。